Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MIS18AQ9NYP9 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms