Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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