Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms