Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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