Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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