Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CIPCQ9C0C6 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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