Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms