Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Krt27Q9Z320 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt27Q9Z320 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms