Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms