Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms