Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms