Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd4Q9Z2D7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd4Q9Z2D7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms