Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr1Q9Z2C4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms