Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ilf3Q9Z1X4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms