Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VarsQ9Z1Q9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms