Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lgr5Q9Z1P4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms