Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms