Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms