Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cog1Q9Z160 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog1Q9Z160 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms