Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms