Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms