Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms