Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb6Q9Z0T9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms