Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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