Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms