Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms