Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PplQ9R269 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PplQ9R269 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PplQ9R269 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms