Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TapbpQ9R233 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms