Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms