Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms