Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slit2Q9R1B9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slit2Q9R1B9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms