Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf346Q9R0B7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf346Q9R0B7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms