Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nek3Q9R0A5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms