Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afyQ9QZQ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms