Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms