Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms