Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms