Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx4Q9QY61 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms