Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan3Q9QY33 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan3Q9QY33 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms