Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms