Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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