Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip4Q9QXN3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms