Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psma6Q9QUM9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psma6Q9QUM9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms