Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP1Q9NZU7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms