Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnaja4Q9JMC3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms