Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms