Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Thsd1Q9JM61 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Thsd1Q9JM61 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Thsd1Q9JM61 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Thsd1Q9JM61 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Thsd1Q9JM61 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Thsd1Q9JM61 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Thsd1Q9JM61 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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