Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms