Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms