Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Habp4Q9JKS5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms